Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RNF5Q99942 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RNF5Q99942 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RNF5Q99942 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RNF5Q99942 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RNF5Q99942 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RNF5Q99942 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RNF5Q99942 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RNF5Q99942 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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