Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms