Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms