Protein–RNA interactions for Protein: Q99208

YLL066C, Y' element ATP-dependent helicase YLL066C, yeastyeast

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL066CQ99208 MLP2YIL149C 5040 nt0.83□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 RKR1YMR247C 4689 nt0.82□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 YER181CYER181C 324 nt0.82□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.82□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 CHS6YJL099W 2241 nt0.81□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 PRP5YBR237W 2550 nt0.81□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.81□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.81□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 FYV10YIL097W 1551 nt0.8□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 RPM2YML091C 3609 nt0.8□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 snR74snR74 88 nt0.8□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 NPR2YEL062W 1848 nt0.8□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 YJR029WYJR029W 5268 nt0.79□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.79□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.79□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 YLR282CYLR282C 342 nt0.79□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 COX5BYIL111W 456 nt0.78□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 YLR041WYLR041W 321 nt0.78□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.77□□□□□ -2.29
YLL066CQ99208 snR49snR49 165 nt0.77□□□□□ -2.29
YLL066CQ99208 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.76□□□□□ -2.29
YLL066CQ99208 COX12YLR038C 252 nt0.76□□□□□ -2.29
YLL066CQ99208 COY1YKL179C 2040 nt0.75□□□□□ -2.29
YLL066CQ99208 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.75□□□□□ -2.29
YLL066CQ99208 YCR022CYCR022C 345 nt0.74□□□□□ -2.29
YLL066CQ99208 OST4YDL232W 111 nt0.73□□□□□ -2.29
YLL066CQ99208 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.73□□□□□ -2.29
YLL066CQ99208 YKU70YMR284W 1809 nt0.73□□□□□ -2.29
YLL066CQ99208 snR55snR55 98 nt0.72□□□□□ -2.29
YLL066CQ99208 ULI1YFR026C 510 nt0.71□□□□□ -2.3
YLL066CQ99208 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.71□□□□□ -2.3
YLL066CQ99208 YML002WYML002W 2214 nt0.71□□□□□ -2.3
YLL066CQ99208 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.7□□□□□ -2.3
YLL066CQ99208 BLI1YKL061W 342 nt0.7□□□□□ -2.3
YLL066CQ99208 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.7□□□□□ -2.3
YLL066CQ99208 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.7□□□□□ -2.3
YLL066CQ99208 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.7□□□□□ -2.3
YLL066CQ99208 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.7□□□□□ -2.3
YLL066CQ99208 PRP42YDR235W 1635 nt0.69□□□□□ -2.3
YLL066CQ99208 TAH1YCR060W 336 nt0.69□□□□□ -2.3
YLL066CQ99208 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.68□□□□□ -2.3
YLL066CQ99208 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.68□□□□□ -2.3
YLL066CQ99208 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.67□□□□□ -2.3
YLL066CQ99208 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.66□□□□□ -2.3
YLL066CQ99208 YOR345CYOR345C 351 nt0.65□□□□□ -2.31
YLL066CQ99208 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.64□□□□□ -2.31
YLL066CQ99208 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.64□□□□□ -2.31
YLL066CQ99208 ABF2YMR072W 552 nt0.64□□□□□ -2.31
YLL066CQ99208 MLP1YKR095W 5628 nt0.64□□□□□ -2.31
YLL066CQ99208 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.62□□□□□ -2.31
YLL066CQ99208 YDR366CYDR366C 399 nt0.6□□□□□ -2.31
YLL066CQ99208 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.6□□□□□ -2.31
YLL066CQ99208 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.59□□□□□ -2.32
YLL066CQ99208 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.58□□□□□ -2.32
YLL066CQ99208 YGL041CYGL041C 204 nt0.58□□□□□ -2.32
YLL066CQ99208 APQ12YIL040W 417 nt0.58□□□□□ -2.32
YLL066CQ99208 YOR302WYOR302W 78 nt0.57□□□□□ -2.32
YLL066CQ99208 PET111YMR257C 2403 nt0.56□□□□□ -2.32
YLL066CQ99208 snR8snR8 190 nt0.56□□□□□ -2.32
YLL066CQ99208 SNU13YEL026W 381 nt0.55□□□□□ -2.32
YLL066CQ99208 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.55□□□□□ -2.32
YLL066CQ99208 NNF2YGR089W 2811 nt0.54□□□□□ -2.32
YLL066CQ99208 ESP1YGR098C 4893 nt0.54□□□□□ -2.32
YLL066CQ99208 PRP39YML046W 1890 nt0.53□□□□□ -2.32
YLL066CQ99208 NIP1YMR309C 2439 nt0.52□□□□□ -2.33
YLL066CQ99208 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.5□□□□□ -2.33
YLL066CQ99208 snR80snR80 171 nt0.49□□□□□ -2.33
YLL066CQ99208 RPS26AYGL189C 360 nt0.49□□□□□ -2.33
YLL066CQ99208 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.48□□□□□ -2.33
YLL066CQ99208 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.48□□□□□ -2.33
YLL066CQ99208 YLR232WYLR232W 348 nt0.48□□□□□ -2.33
YLL066CQ99208 SBH1YER087C-B 249 nt0.45□□□□□ -2.34
YLL066CQ99208 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.44□□□□□ -2.34
YLL066CQ99208 UTP10YJL109C 5310 nt0.44□□□□□ -2.34
YLL066CQ99208 CSE1YGL238W 2883 nt0.44□□□□□ -2.34
YLL066CQ99208 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.42□□□□□ -2.34
YLL066CQ99208 RCO1YMR075W 2055 nt0.4□□□□□ -2.34
YLL066CQ99208 GLG1YKR058W 1851 nt0.4□□□□□ -2.34
YLL066CQ99208 snR46snR46 197 nt0.4□□□□□ -2.35
YLL066CQ99208 ORC3YLL004W 1851 nt0.39□□□□□ -2.35
YLL066CQ99208 YJL182CYJL182C 318 nt0.39□□□□□ -2.35
YLL066CQ99208 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.39□□□□□ -2.35
YLL066CQ99208 YGL182CYGL182C 324 nt0.37□□□□□ -2.35
YLL066CQ99208 YEL073CYEL073C 324 nt0.35□□□□□ -2.35
YLL066CQ99208 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt0.34□□□□□ -2.35
YLL066CQ99208 SDH6YDR379C-A 240 nt0.33□□□□□ -2.36
YLL066CQ99208 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.33□□□□□ -2.36
YLL066CQ99208 YEL014CYEL014C 306 nt0.32□□□□□ -2.36
YLL066CQ99208 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.32□□□□□ -2.36
YLL066CQ99208 COG6YNL041C 2520 nt0.31□□□□□ -2.36
YLL066CQ99208 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.31□□□□□ -2.36
YLL066CQ99208 SPG3YDR504C 384 nt0.29□□□□□ -2.36
YLL066CQ99208 YOR170WYOR170W 306 nt0.29□□□□□ -2.36
YLL066CQ99208 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.29□□□□□ -2.36
YLL066CQ99208 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.27□□□□□ -2.37
YLL066CQ99208 YDR544CYDR544C 429 nt0.26□□□□□ -2.37
YLL066CQ99208 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.25□□□□□ -2.37
YLL066CQ99208 JLP2YMR132C 627 nt0.22□□□□□ -2.37
YLL066CQ99208 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.21□□□□□ -2.38
YLL066CQ99208 snR45snR45 172 nt0.21□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 64.3 ms