Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms