Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD6Q96NK8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms