Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms