Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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