Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELP4Q96EB1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms