Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms