Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTLL11Q8NHH1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL11Q8NHH1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL11Q8NHH1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL11Q8NHH1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL11Q8NHH1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL11Q8NHH1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL11Q8NHH1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL11Q8NHH1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL11Q8NHH1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL11Q8NHH1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL11Q8NHH1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms