Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSGALNACT2Q8N6G5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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