Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms