Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX4Q8IY92 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLX4Q8IY92 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms