Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NME9Q86XW9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms