Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms