Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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