Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms