Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC29A4Q7RTT9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms