Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms