Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP12Q6UXS9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms