Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUSD1Q6UWL2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms