Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC27A4Q6P1M0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms