Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LHX8Q68G74 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms