Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC30Q5VVM6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms