Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP55Q53EZ4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms