Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms