Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
DUSP6Q16828 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP6Q16828 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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