Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXD1Q16676 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
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