Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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