Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms