Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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RYR3Q15413 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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