Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
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