Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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