Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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