Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX2Q14781 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX2Q14781 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms