Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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