Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
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SHROOM2Q13796 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
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SHROOM2Q13796 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
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SHROOM2Q13796 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
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SHROOM2Q13796 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
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SHROOM2Q13796 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
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