Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
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