Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
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