Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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