Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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