Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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NFX1Q12986 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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