Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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