Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SREBF2Q12772 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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