Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 YAL066WYAL066W 309 nt-1.52□□□□□ -2.65
RTR2Q12378 YFL012WYFL012W 447 nt-1.53□□□□□ -2.65
RTR2Q12378 YAR047CYAR047C 321 nt-1.53□□□□□ -2.65
RTR2Q12378 APQ12YIL040W 417 nt-1.54□□□□□ -2.66
RTR2Q12378 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-1.54□□□□□ -2.66
RTR2Q12378 YIL032CYIL032C 357 nt-1.55□□□□□ -2.66
RTR2Q12378 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.55□□□□□ -2.66
RTR2Q12378 YFL063WYFL063W 456 nt-1.56□□□□□ -2.66
RTR2Q12378 YER053C-AYER053C-A 114 nt-1.57□□□□□ -2.66
RTR2Q12378 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt-1.57□□□□□ -2.66
RTR2Q12378 GPI15YNL038W 690 nt-1.57□□□□□ -2.66
RTR2Q12378 YGL052WYGL052W 306 nt-1.6□□□□□ -2.67
RTR2Q12378 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt-1.6□□□□□ -2.67
RTR2Q12378 PRM3YPL192C 402 nt-1.62□□□□□ -2.67
RTR2Q12378 CBS1YDL069C 690 nt-1.64□□□□□ -2.67
RTR2Q12378 YHR125WYHR125W 306 nt-1.66□□□□□ -2.68
RTR2Q12378 YOR170WYOR170W 306 nt-1.66□□□□□ -2.68
RTR2Q12378 snR74snR74 88 nt-1.67□□□□□ -2.68
RTR2Q12378 YDR544CYDR544C 429 nt-1.68□□□□□ -2.68
RTR2Q12378 VPS20YMR077C 666 nt-1.68□□□□□ -2.68
RTR2Q12378 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-1.68□□□□□ -2.68
RTR2Q12378 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-1.7□□□□□ -2.68
RTR2Q12378 YGR069WYGR069W 336 nt-1.74□□□□□ -2.69
RTR2Q12378 RPS27BYHR021C 249 nt-1.74□□□□□ -2.69
RTR2Q12378 CSE2YNR010W 450 nt-1.79□□□□□ -2.7
RTR2Q12378 PMP2YEL017C-A 132 nt-1.8□□□□□ -2.7
RTR2Q12378 CSN9YDR179C 489 nt-1.81□□□□□ -2.7
RTR2Q12378 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-1.81□□□□□ -2.7
RTR2Q12378 TOM22YNL131W 459 nt-1.81□□□□□ -2.7
RTR2Q12378 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-1.82□□□□□ -2.7
RTR2Q12378 JLP2YMR132C 627 nt-1.82□□□□□ -2.7
RTR2Q12378 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.84□□□□□ -2.7
RTR2Q12378 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt-1.85□□□□□ -2.71
RTR2Q12378 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-1.85□□□□□ -2.71
RTR2Q12378 YAF9YNL107W 681 nt-1.85□□□□□ -2.71
RTR2Q12378 snR189snR189 189 nt-1.85□□□□□ -2.71
RTR2Q12378 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-1.85□□□□□ -2.71
RTR2Q12378 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-1.86□□□□□ -2.71
RTR2Q12378 EAF6YJR082C 342 nt-1.87□□□□□ -2.71
RTR2Q12378 snR54snR54 86 nt-1.87□□□□□ -2.71
RTR2Q12378 MPC1YGL080W 393 nt-1.88□□□□□ -2.71
RTR2Q12378 snR50snR50 90 nt-1.9□□□□□ -2.71
RTR2Q12378 BI2Q0110 1272 nt-1.92□□□□□ -2.72
RTR2Q12378 YNL266WYNL266W 420 nt-1.93□□□□□ -2.72
RTR2Q12378 HMRA1YCR097W 381 nt-1.95□□□□□ -2.72
RTR2Q12378 YER090C-AYER090C-A 90 nt-1.97□□□□□ -2.72
RTR2Q12378 YML099W-AYML099W-A 330 nt-1.97□□□□□ -2.72
RTR2Q12378 Q0255Q0255 1419 nt-1.99□□□□□ -2.73
RTR2Q12378 YER006C-AYER006C-A 318 nt-2.01□□□□□ -2.73
RTR2Q12378 YOR121CYOR121C 306 nt-2.01□□□□□ -2.73
RTR2Q12378 snR69snR69 101 nt-2.02□□□□□ -2.73
RTR2Q12378 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-2.02□□□□□ -2.73
RTR2Q12378 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-2.02□□□□□ -2.73
RTR2Q12378 YBR285WYBR285W 435 nt-2.02□□□□□ -2.73
RTR2Q12378 RDS3YPR094W 324 nt-2.03□□□□□ -2.73
RTR2Q12378 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt-2.04□□□□□ -2.74
RTR2Q12378 snR39BsnR39B 96 nt-2.05□□□□□ -2.74
RTR2Q12378 snR81snR81 201 nt-2.06□□□□□ -2.74
RTR2Q12378 YER137W-AYER137W-A 306 nt-2.06□□□□□ -2.74
RTR2Q12378 YGL149WYGL149W 306 nt-2.06□□□□□ -2.74
RTR2Q12378 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-2.07□□□□□ -2.74
RTR2Q12378 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-2.07□□□□□ -2.74
RTR2Q12378 YDR102CYDR102C 333 nt-2.09□□□□□ -2.74
RTR2Q12378 YNL205CYNL205C 423 nt-2.1□□□□□ -2.75
RTR2Q12378 snR67snR67 82 nt-2.11□□□□□ -2.75
RTR2Q12378 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-2.11□□□□□ -2.75
RTR2Q12378 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-2.13□□□□□ -2.75
RTR2Q12378 YDR048CYDR048C 315 nt-2.15□□□□□ -2.75
RTR2Q12378 YKL123WYKL123W 381 nt-2.15□□□□□ -2.75
RTR2Q12378 YML054C-AYML054C-A 159 nt-2.15□□□□□ -2.75
RTR2Q12378 snR77snR77 88 nt-2.16□□□□□ -2.76
RTR2Q12378 YDR543CYDR543C 300 nt-2.16□□□□□ -2.76
RTR2Q12378 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-2.16□□□□□ -2.76
RTR2Q12378 STE18YJR086W 333 nt-2.17□□□□□ -2.76
RTR2Q12378 YLR434CYLR434C 384 nt-2.17□□□□□ -2.76
RTR2Q12378 snR41snR41 95 nt-2.17□□□□□ -2.76
RTR2Q12378 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-2.18□□□□□ -2.76
RTR2Q12378 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-2.19□□□□□ -2.76
RTR2Q12378 YDL158CYDL158C 309 nt-2.2□□□□□ -2.76
RTR2Q12378 snR60snR60 104 nt-2.23□□□□□ -2.77
RTR2Q12378 YLR202CYLR202C 327 nt-2.24□□□□□ -2.77
RTR2Q12378 YNL122CYNL122C 348 nt-2.24□□□□□ -2.77
RTR2Q12378 YER097WYER097W 330 nt-2.29□□□□□ -2.78
RTR2Q12378 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-2.34□□□□□ -2.78
RTR2Q12378 YFL032WYFL032W 321 nt-2.35□□□□□ -2.79
RTR2Q12378 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-2.35□□□□□ -2.79
RTR2Q12378 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-2.37□□□□□ -2.79
RTR2Q12378 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.38□□□□□ -2.79
RTR2Q12378 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-2.39□□□□□ -2.79
RTR2Q12378 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-2.39□□□□□ -2.79
RTR2Q12378 YNL028WYNL028W 318 nt-2.41□□□□□ -2.8
RTR2Q12378 YNL324WYNL324W 396 nt-2.41□□□□□ -2.8
RTR2Q12378 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-2.43□□□□□ -2.8
RTR2Q12378 YFL019CYFL019C 354 nt-2.46□□□□□ -2.8
RTR2Q12378 Q0142Q0142 177 nt-2.47□□□□□ -2.8
RTR2Q12378 YBR178WYBR178W 375 nt-2.47□□□□□ -2.8
RTR2Q12378 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-2.48□□□□□ -2.81
RTR2Q12378 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-2.49□□□□□ -2.81
RTR2Q12378 ATP6Q0085 780 nt-2.5□□□□□ -2.81
RTR2Q12378 YOR309CYOR309C 381 nt-2.5□□□□□ -2.81
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