Protein–RNA interactions for Protein: Q12218

TIR4, Cell wall protein TIR4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIR4Q12218 SPG3YDR504C 384 nt0.6□□□□□ -2.31
TIR4Q12218 UTP8YGR128C 2142 nt0.6□□□□□ -2.31
TIR4Q12218 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.6□□□□□ -2.31
TIR4Q12218 UBP3YER151C 2739 nt0.6□□□□□ -2.31
TIR4Q12218 UTP10YJL109C 5310 nt0.6□□□□□ -2.31
TIR4Q12218 YDL073WYDL073W 2955 nt0.6□□□□□ -2.31
TIR4Q12218 PRP5YBR237W 2550 nt0.58□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 YEL014CYEL014C 306 nt0.58□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.58□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 PAM16YJL104W 450 nt0.58□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.58□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 HAL9YOL089C 3093 nt0.57□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 YLR041WYLR041W 321 nt0.57□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.57□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 OST4YDL232W 111 nt0.56□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 PRP42YDR235W 1635 nt0.56□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.55□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.55□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.55□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.55□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.55□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.55□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.55□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.55□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.55□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.55□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.55□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 JLP2YMR132C 627 nt0.55□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 TRS65YGR166W 1683 nt0.55□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 BEM3YPL115C 3387 nt0.54□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.54□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.54□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.54□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.53□□□□□ -2.32
TIR4Q12218 SNU13YEL026W 381 nt0.52□□□□□ -2.33
TIR4Q12218 STF2YGR008C 255 nt0.52□□□□□ -2.33
TIR4Q12218 YJL182CYJL182C 318 nt0.52□□□□□ -2.33
TIR4Q12218 HUG1YML058W-A 207 nt0.52□□□□□ -2.33
TIR4Q12218 YSP1YHR155W 3687 nt0.52□□□□□ -2.33
TIR4Q12218 YLR232WYLR232W 348 nt0.51□□□□□ -2.33
TIR4Q12218 snR52snR52 92 nt0.51□□□□□ -2.33
TIR4Q12218 PRP39YML046W 1890 nt0.5□□□□□ -2.33
TIR4Q12218 TAH1YCR060W 336 nt0.49□□□□□ -2.33
TIR4Q12218 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.49□□□□□ -2.33
TIR4Q12218 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.49□□□□□ -2.33
TIR4Q12218 LTE1YAL024C 4308 nt0.49□□□□□ -2.33
TIR4Q12218 PET111YMR257C 2403 nt0.49□□□□□ -2.33
TIR4Q12218 YEL073CYEL073C 324 nt0.48□□□□□ -2.33
TIR4Q12218 snR46snR46 197 nt0.48□□□□□ -2.33
TIR4Q12218 NNF2YGR089W 2811 nt0.47□□□□□ -2.33
TIR4Q12218 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.46□□□□□ -2.34
TIR4Q12218 YGL182CYGL182C 324 nt0.45□□□□□ -2.34
TIR4Q12218 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.45□□□□□ -2.34
TIR4Q12218 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.45□□□□□ -2.34
TIR4Q12218 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.44□□□□□ -2.34
TIR4Q12218 YDR544CYDR544C 429 nt0.43□□□□□ -2.34
TIR4Q12218 PAU12YGR294W 363 nt0.43□□□□□ -2.34
TIR4Q12218 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.41□□□□□ -2.34
TIR4Q12218 YMR160WYMR160W 2451 nt0.4□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 SBH1YER087C-B 249 nt0.4□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 MLP1YKR095W 5628 nt0.39□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 NIP1YMR309C 2439 nt0.39□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.39□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 RPS26AYGL189C 360 nt0.39□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 YJL150WYJL150W 303 nt0.39□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 GLG1YKR058W 1851 nt0.39□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 UTP20YBL004W 7482 nt0.39□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 SDH6YDR379C-A 240 nt0.38□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 ULP2YIL031W 3105 nt0.38□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 COG6YNL041C 2520 nt0.37□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.37□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.37□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.37□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.37□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.37□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.37□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.37□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.37□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 YOR170WYOR170W 306 nt0.37□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 CSE1YGL238W 2883 nt0.35□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.35□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 ORC3YLL004W 1851 nt0.35□□□□□ -2.35
TIR4Q12218 YNL337WYNL337W 255 nt0.33□□□□□ -2.36
TIR4Q12218 BUL2YML111W 2763 nt0.33□□□□□ -2.36
TIR4Q12218 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.32□□□□□ -2.36
TIR4Q12218 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.32□□□□□ -2.36
TIR4Q12218 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.32□□□□□ -2.36
TIR4Q12218 BIR1YJR089W 2865 nt0.3□□□□□ -2.36
TIR4Q12218 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.3□□□□□ -2.36
TIR4Q12218 snR48snR48 113 nt0.3□□□□□ -2.36
TIR4Q12218 YDR210WYDR210W 228 nt0.29□□□□□ -2.36
TIR4Q12218 YGR151CYGR151C 336 nt0.29□□□□□ -2.36
TIR4Q12218 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.29□□□□□ -2.36
TIR4Q12218 FMP27YLR454W 7887 nt0.29□□□□□ -2.36
TIR4Q12218 RCO1YMR075W 2055 nt0.28□□□□□ -2.36
TIR4Q12218 YNL198CYNL198C 303 nt0.28□□□□□ -2.36
TIR4Q12218 YOR102WYOR102W 351 nt0.28□□□□□ -2.36
TIR4Q12218 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.27□□□□□ -2.37
TIR4Q12218 RPM2YML091C 3609 nt0.26□□□□□ -2.37
TIR4Q12218 QCR9YGR183C 201 nt0.26□□□□□ -2.37
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