Protein–RNA interactions for Protein: Q12144

PER33, Pore and endoplasmic reticulum protein of 33 kDa, yeastyeast

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PER33Q12144 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.08□□□□□ -2.4
PER33Q12144 snR60snR60 104 nt0.07□□□□□ -2.4
PER33Q12144 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.07□□□□□ -2.4
PER33Q12144 YDR102CYDR102C 333 nt0.06□□□□□ -2.4
PER33Q12144 YGR069WYGR069W 336 nt0.06□□□□□ -2.4
PER33Q12144 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.06□□□□□ -2.4
PER33Q12144 BLI1YKL061W 342 nt0.06□□□□□ -2.4
PER33Q12144 COX12YLR038C 252 nt0.06□□□□□ -2.4
PER33Q12144 YAF9YNL107W 681 nt0.05□□□□□ -2.4
PER33Q12144 YKU70YMR284W 1809 nt0.04□□□□□ -2.4
PER33Q12144 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.04□□□□□ -2.4
PER33Q12144 snR45snR45 172 nt0.04□□□□□ -2.4
PER33Q12144 YIL032CYIL032C 357 nt0.03□□□□□ -2.4
PER33Q12144 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.03□□□□□ -2.4
PER33Q12144 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.03□□□□□ -2.4
PER33Q12144 SNU13YEL026W 381 nt0.02□□□□□ -2.41
PER33Q12144 YEL073CYEL073C 324 nt0.02□□□□□ -2.41
PER33Q12144 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.02□□□□□ -2.41
PER33Q12144 SOV1YMR066W 2697 nt0.01□□□□□ -2.41
PER33Q12144 PRP39YML046W 1890 nt0.01□□□□□ -2.41
PER33Q12144 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0□□□□□ -2.41
PER33Q12144 YDR366CYDR366C 399 nt-0.02□□□□□ -2.41
PER33Q12144 YOR015WYOR015W 360 nt-0.02□□□□□ -2.41
PER33Q12144 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-0.05□□□□□ -2.42
PER33Q12144 YNL028WYNL028W 318 nt-0.05□□□□□ -2.42
PER33Q12144 YFL019CYFL019C 354 nt-0.06□□□□□ -2.42
PER33Q12144 YER053C-AYER053C-A 114 nt-0.07□□□□□ -2.42
PER33Q12144 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-0.07□□□□□ -2.42
PER33Q12144 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-0.07□□□□□ -2.42
PER33Q12144 YPR012WYPR012W 255 nt-0.07□□□□□ -2.42
PER33Q12144 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.07□□□□□ -2.42
PER33Q12144 ATP6Q0085 780 nt-0.09□□□□□ -2.42
PER33Q12144 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-0.09□□□□□ -2.42
PER33Q12144 YPR197CYPR197C 564 nt-0.09□□□□□ -2.42
PER33Q12144 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.09□□□□□ -2.42
PER33Q12144 HMRA1YCR097W 381 nt-0.1□□□□□ -2.43
PER33Q12144 YGL149WYGL149W 306 nt-0.1□□□□□ -2.43
PER33Q12144 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.1□□□□□ -2.43
PER33Q12144 snR36snR36 182 nt-0.1□□□□□ -2.43
PER33Q12144 YLR232WYLR232W 348 nt-0.11□□□□□ -2.43
PER33Q12144 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-0.13□□□□□ -2.43
PER33Q12144 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.13□□□□□ -2.43
PER33Q12144 snR74snR74 88 nt-0.14□□□□□ -2.43
PER33Q12144 GLG1YKR058W 1851 nt-0.15□□□□□ -2.43
PER33Q12144 CSE1YGL238W 2883 nt-0.16□□□□□ -2.43
PER33Q12144 YFL032WYFL032W 321 nt-0.16□□□□□ -2.44
PER33Q12144 snR128snR128 126 nt-0.16□□□□□ -2.44
PER33Q12144 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-0.17□□□□□ -2.44
PER33Q12144 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-0.17□□□□□ -2.44
PER33Q12144 YBR099CYBR099C 384 nt-0.17□□□□□ -2.44
PER33Q12144 RAD61YDR014W 1944 nt-0.19□□□□□ -2.44
PER33Q12144 YGL052WYGL052W 306 nt-0.19□□□□□ -2.44
PER33Q12144 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.2□□□□□ -2.44
PER33Q12144 TAH1YCR060W 336 nt-0.21□□□□□ -2.44
PER33Q12144 snR8snR8 190 nt-0.21□□□□□ -2.44
PER33Q12144 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.21□□□□□ -2.44
PER33Q12144 SDH6YDR379C-A 240 nt-0.21□□□□□ -2.44
PER33Q12144 YER097WYER097W 330 nt-0.22□□□□□ -2.44
PER33Q12144 APQ12YIL040W 417 nt-0.22□□□□□ -2.44
PER33Q12144 RPL39YJL189W 156 nt-0.23□□□□□ -2.45
PER33Q12144 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.24□□□□□ -2.45
PER33Q12144 RPM2YML091C 3609 nt-0.24□□□□□ -2.45
PER33Q12144 YDR413CYDR413C 576 nt-0.25□□□□□ -2.45
PER33Q12144 YKL118WYKL118W 312 nt-0.26□□□□□ -2.45
PER33Q12144 YDR210WYDR210W 228 nt-0.27□□□□□ -2.45
PER33Q12144 EST1YLR233C 2100 nt-0.27□□□□□ -2.45
PER33Q12144 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.28□□□□□ -2.45
PER33Q12144 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-0.28□□□□□ -2.45
PER33Q12144 COG6YNL041C 2520 nt-0.31□□□□□ -2.46
PER33Q12144 YDR544CYDR544C 429 nt-0.31□□□□□ -2.46
PER33Q12144 GIM4YEL003W 336 nt-0.31□□□□□ -2.46
PER33Q12144 SBH2YER019C-A 267 nt-0.31□□□□□ -2.46
PER33Q12144 YGR164WYGR164W 336 nt-0.31□□□□□ -2.46
PER33Q12144 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-0.34□□□□□ -2.46
PER33Q12144 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-0.34□□□□□ -2.46
PER33Q12144 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-0.38□□□□□ -2.47
PER33Q12144 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-0.38□□□□□ -2.47
PER33Q12144 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-0.4□□□□□ -2.47
PER33Q12144 YGL041CYGL041C 204 nt-0.43□□□□□ -2.48
PER33Q12144 YML099W-AYML099W-A 330 nt-0.43□□□□□ -2.48
PER33Q12144 YGL182CYGL182C 324 nt-0.44□□□□□ -2.48
PER33Q12144 YER181CYER181C 324 nt-0.45□□□□□ -2.48
PER33Q12144 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-0.46□□□□□ -2.48
PER33Q12144 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-0.49□□□□□ -2.49
PER33Q12144 snR46snR46 197 nt-0.49□□□□□ -2.49
PER33Q12144 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.51□□□□□ -2.49
PER33Q12144 SEC10YLR166C 2616 nt-0.52□□□□□ -2.49
PER33Q12144 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-0.53□□□□□ -2.49
PER33Q12144 snR55snR55 98 nt-0.55□□□□□ -2.5
PER33Q12144 snR56snR56 88 nt-0.55□□□□□ -2.5
PER33Q12144 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-0.55□□□□□ -2.5
PER33Q12144 YJL182CYJL182C 318 nt-0.55□□□□□ -2.5
PER33Q12144 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.55□□□□□ -2.5
PER33Q12144 snR49snR49 165 nt-0.55□□□□□ -2.5
PER33Q12144 snR65snR65 100 nt-0.56□□□□□ -2.5
PER33Q12144 YEL014CYEL014C 306 nt-0.56□□□□□ -2.5
PER33Q12144 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.56□□□□□ -2.5
PER33Q12144 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.56□□□□□ -2.5
PER33Q12144 URB1YKL014C 5295 nt-0.56□□□□□ -2.5
PER33Q12144 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.58□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.1 ms