Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOBRQ0VD83 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms