Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FMODQ06828 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FMODQ06828 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FMODQ06828 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FMODQ06828 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms